Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCSD1Q6JBY9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms