Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SDE2Q6IQ49 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDE2Q6IQ49 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDE2Q6IQ49 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms