Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPPQ6IPU0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPPQ6IPU0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms