Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTC19Q6DKK2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC19Q6DKK2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms