Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LHX8Q68G74 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LHX8Q68G74 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX8Q68G74 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms