Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC102BQ68D86 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC102BQ68D86 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms