Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf57Q5W0N0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf57Q5W0N0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf57Q5W0N0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf57Q5W0N0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf57Q5W0N0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf57Q5W0N0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf57Q5W0N0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf57Q5W0N0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf57Q5W0N0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf57Q5W0N0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf57Q5W0N0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf57Q5W0N0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf57Q5W0N0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf57Q5W0N0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf57Q5W0N0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf57Q5W0N0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf57Q5W0N0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf57Q5W0N0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf57Q5W0N0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf57Q5W0N0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf57Q5W0N0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf57Q5W0N0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C9orf57Q5W0N0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
C9orf57Q5W0N0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf57Q5W0N0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf57Q5W0N0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf57Q5W0N0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf57Q5W0N0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf57Q5W0N0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf57Q5W0N0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf57Q5W0N0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf57Q5W0N0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf57Q5W0N0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf57Q5W0N0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf57Q5W0N0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf57Q5W0N0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C9orf57Q5W0N0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms