Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ECM29Q5VYK3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ECM29Q5VYK3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms