Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF8Q5VWM4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF8Q5VWM4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF8Q5VWM4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF8Q5VWM4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF8Q5VWM4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF8Q5VWM4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF8Q5VWM4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF8Q5VWM4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms