Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF3Q5VWG9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF3Q5VWG9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms