Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTUD1Q5VV17 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUD1Q5VV17 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTUD1Q5VV17 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 705.7 ms