Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAF4Q5VUM1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms