Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTQ0

TTC39B, Tetratricopeptide repeat protein 39B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39BQ5VTQ0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC39BQ5VTQ0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTC39BQ5VTQ0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTC39BQ5VTQ0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTC39BQ5VTQ0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39BQ5VTQ0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39BQ5VTQ0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39BQ5VTQ0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39BQ5VTQ0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39BQ5VTQ0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39BQ5VTQ0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39BQ5VTQ0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39BQ5VTQ0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39BQ5VTQ0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39BQ5VTQ0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39BQ5VTQ0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC39BQ5VTQ0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC39BQ5VTQ0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC39BQ5VTQ0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC39BQ5VTQ0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC39BQ5VTQ0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC39BQ5VTQ0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC39BQ5VTQ0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC39BQ5VTQ0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC39BQ5VTQ0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms