Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR78Q5VTH9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR78Q5VTH9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR78Q5VTH9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR78Q5VTH9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR78Q5VTH9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR78Q5VTH9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR78Q5VTH9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
WDR78Q5VTH9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WDR78Q5VTH9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
WDR78Q5VTH9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms