Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRIP1Q5VSL9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
STRIP1Q5VSL9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms