Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RIF1Q5UIP0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIF1Q5UIP0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms