Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF5Q5TYX0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms