Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO4Q5TGY1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMCO4Q5TGY1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMCO4Q5TGY1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO4Q5TGY1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO4Q5TGY1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO4Q5TGY1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO4Q5TGY1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO4Q5TGY1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO4Q5TGY1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO4Q5TGY1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO4Q5TGY1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO4Q5TGY1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO4Q5TGY1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO4Q5TGY1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO4Q5TGY1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO4Q5TGY1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO4Q5TGY1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO4Q5TGY1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO4Q5TGY1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO4Q5TGY1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO4Q5TGY1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO4Q5TGY1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms