Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH8Q5T0T0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH8Q5T0T0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms