Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FRMPD1Q5SYB0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
FRMPD1Q5SYB0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
FRMPD1Q5SYB0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.4 ms