Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAX1Q5SQQ9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAX1Q5SQQ9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms