Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYL7

TMEM196, Transmembrane protein 196, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM196Q5HYL7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM196Q5HYL7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM196Q5HYL7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM196Q5HYL7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM196Q5HYL7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM196Q5HYL7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM196Q5HYL7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM196Q5HYL7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM196Q5HYL7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM196Q5HYL7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM196Q5HYL7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM196Q5HYL7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM196Q5HYL7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM196Q5HYL7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM196Q5HYL7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM196Q5HYL7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM196Q5HYL7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM196Q5HYL7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM196Q5HYL7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM196Q5HYL7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM196Q5HYL7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM196Q5HYL7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms