Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF7

HSP90AB3P, Putative heat shock protein HSP 90-beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB3PQ58FF7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HSP90AB3PQ58FF7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HSP90AB3PQ58FF7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms