Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ANKRD39Q53RE8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ANKRD39Q53RE8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms