Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS7

GLE1, Nucleoporin GLE1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLE1Q53GS7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLE1Q53GS7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLE1Q53GS7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLE1Q53GS7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLE1Q53GS7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLE1Q53GS7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLE1Q53GS7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLE1Q53GS7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLE1Q53GS7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLE1Q53GS7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLE1Q53GS7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLE1Q53GS7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLE1Q53GS7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLE1Q53GS7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLE1Q53GS7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLE1Q53GS7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLE1Q53GS7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLE1Q53GS7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLE1Q53GS7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLE1Q53GS7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLE1Q53GS7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLE1Q53GS7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms