Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP55Q53EZ4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP55Q53EZ4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP55Q53EZ4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms