Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC184Q52MB2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC184Q52MB2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC184Q52MB2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC184Q52MB2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC184Q52MB2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC184Q52MB2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC184Q52MB2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC184Q52MB2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC184Q52MB2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC184Q52MB2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC184Q52MB2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC184Q52MB2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC184Q52MB2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms