Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP221Q4G0U5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP221Q4G0U5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms