Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRY2Q49AN0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRY2Q49AN0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRY2Q49AN0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRY2Q49AN0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRY2Q49AN0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRY2Q49AN0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CRY2Q49AN0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRY2Q49AN0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRY2Q49AN0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRY2Q49AN0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRY2Q49AN0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRY2Q49AN0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRY2Q49AN0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CRY2Q49AN0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CRY2Q49AN0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRY2Q49AN0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRY2Q49AN0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CRY2Q49AN0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRY2Q49AN0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CRY2Q49AN0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRY2Q49AN0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRY2Q49AN0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms