Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TYSND1Q2T9J0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TYSND1Q2T9J0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms