Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ISXQ2M1V0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ISXQ2M1V0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms