Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q1T7F1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q1T7F1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q1T7F1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q1T7F1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q1T7F1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q1T7F1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q1T7F1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q1T7F1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q1T7F1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q1T7F1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q1T7F1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q1T7F1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q1T7F1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q1T7F1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q1T7F1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q1T7F1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q1T7F1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q1T7F1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q1T7F1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q1T7F1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q1T7F1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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