Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSPP1Q1MSJ5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSPP1Q1MSJ5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
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