Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLPPQ16740 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CLPPQ16740 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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