Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX1AQ16623 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX1AQ16623 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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