Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA1EQ15878 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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