Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85BQ15834 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC85BQ15834 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
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