Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRRQ15256 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRRQ15256 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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