Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNIP1Q15025 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNIP1Q15025 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNIP1Q15025 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNIP1Q15025 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNIP1Q15025 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNIP1Q15025 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNIP1Q15025 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNIP1Q15025 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNIP1Q15025 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNIP1Q15025 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNIP1Q15025 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNIP1Q15025 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNIP1Q15025 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNIP1Q15025 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNIP1Q15025 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TNIP1Q15025 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNIP1Q15025 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNIP1Q15025 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNIP1Q15025 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TNIP1Q15025 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNIP1Q15025 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNIP1Q15025 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNIP1Q15025 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNIP1Q15025 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNIP1Q15025 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNIP1Q15025 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNIP1Q15025 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNIP1Q15025 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNIP1Q15025 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNIP1Q15025 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNIP1Q15025 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNIP1Q15025 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNIP1Q15025 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNIP1Q15025 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNIP1Q15025 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNIP1Q15025 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNIP1Q15025 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNIP1Q15025 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TNIP1Q15025 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNIP1Q15025 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNIP1Q15025 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNIP1Q15025 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNIP1Q15025 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
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