Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAPHQ15003 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAPHQ15003 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
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