Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GINS1Q14691 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GINS1Q14691 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GINS1Q14691 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GINS1Q14691 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GINS1Q14691 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GINS1Q14691 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GINS1Q14691 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GINS1Q14691 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GINS1Q14691 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GINS1Q14691 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GINS1Q14691 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GINS1Q14691 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GINS1Q14691 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GINS1Q14691 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GINS1Q14691 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GINS1Q14691 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GINS1Q14691 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GINS1Q14691 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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