Protein–RNA interactions for Protein: Q14409

GK3P, Glycerol kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GK3PQ14409 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GK3PQ14409 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GK3PQ14409 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms