Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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