Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A6Q14031 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A6Q14031 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
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