Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB2AQ13885 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB2AQ13885 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms