Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKP1Q13835 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms