Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCOA4Q13772 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCOA4Q13772 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
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