Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL4BQ13620 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
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