Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XRCC4Q13426 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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