Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AP3B2Q13367 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3B2Q13367 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
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